Musim ke 1

Julien, Maurice, dan Pancho bersama menaiki kapal selam dan merenungkan langkah selanjutnya, sementara Mort yang ditawan berencana menjatuhkan raja baru yang kejam.

Clover berharap gurunya Sage dapat membantu merencanakan penggulingan Koto, yang kini menjadikan Mort pelawaknya. Julien dan kru bertemu suku lemur betina yang memesona.

Mort memimpin gerakan untuk menjatuhkan Koto. Julien, Maurice, dan Pancho terancam dikorbankan ke monster bertentakel. Gurunya Sage tidak seperti yang diharapkan Clover.

Saat Julien dan teman-temannya kembali ke Madagaskar, kapal selam mereka mengalami masalah. Mort bersandiwara di hadapan Koto untuk menutupi pelarian para tawanan.

Julien dan para rekannya bekerja sama dengan hiu dan mencoba membentuk pasukan. Peta Jarsh-Jarsh membawa Clover dan Sage ke dalam bahaya. Rencana pelarian Mort terhambat.

Sekelompok simpanse antariksa Rusia yang marah mungkin jadi harapan terbaik Julien untuk melawan Koto. Mort menemukan Timo terkunci dalam kapsul dan meminta bantuannya.

Clover menimbang lagi keputusannya bergabung dengan sekte Pam. Mort memakai radio Timo untuk mengontak Julien dan teman-temannya yang terlibat masalah dengan simpanse.

Dengan menyamar, Julien dan teman-temannya mencoba menumpang di sebuah kapal Foosa. Jarsh-Jarsh memberi Clover tantangan baru yang membingungkan.

Julien dan Maurice menghadapi perkelahian mengerikan di sekolah gladiator. Mort melakukan perjalanan ke dimensi lain. Sage meyakinkan Clover bahwa Koto punya sisi baik.

Koloni makhluk berbentuk lonceng mengangkat Maurice sebagai Yang Terpilih. Julien terjebak di alam lain dan menjalani sidang penentu hidupnya. Mort melawan Morticus Khan.

Julien dan Karl bersiap untuk menghentikan pernikahan Koto dengan Putri Buaya. Clover menghadapi Koto dengan caranya sendiri. Mort berupaya mengembalikan "Mort Cerdas".

Saat Koto menyiapkan tumbal untuk memulai upacara pernikahannya, Clover dan Sage mengeluarkan senjata baru mereka. Mort, Maurice, dan Pancho tiba membawa bala bantuan.

Saat hampir dikalahkan pasukan Koto, Julien mengerahkan pasukan Mort, siput lonceng, simpanse antariksa, Clover, dan teman-teman setia lainnya sebagai upaya terakhirnya.