Musim ke 2

Selama Gotham terpaku pada sidang Rupert Thorne, Batman melindungi jalanan dari dampak penangkapan sang bos kriminal dan letnannya yang merajalela, Eddie Nygma alias The Riddler!

Setelah beberapa serangan pada Triad Industries, Batman harus melacak dan menghentikan pemakai roket yang ingin balas dendam sebelum perbuatannya merenggut nyawa orang tak bersalah! Namun, saat sang Detektif Dark Knight mengungkapkan misterinya, dia menemukan hal mengejutkan!

Selama Rupert Thorne menghilang dan penggantinya, Eddie Nygma (The Riddler), merajalela di Gotham, kekerasan brutal di jalanan dan perampokan terang-terangan makin marak, dan GCPD kekurangan orang untuk mencegah semua itu. Demi mendapat informasi tentang keberadaan Thorne dan menyelidiki latar belakang tangan kanan barunya, Nygma, Batman menyusup ke penjara Blackgate sebagai Matches Malone!

Tempat kejadian pembunuhan dengan simbol kelelawar berdarah menjadi masalah bagi Batman. Berkat kampanye pencemaran nama Hattie Tetch, sang Detektif Dark Knight makin diragukan oleh masyarakat. Saat berusaha membersihkan namanya, Batman menemukan kultus kelelawar fanatik yang dipimpin pendeta karismatik, Mad Monk.

Detektif Jim Corrigan yang dipecat secara tidak hormat menjadi sukarelawan dalam eksperimen penjara demi menebus dirinya, tapi hasilnya jauh lebih mengerikan daripada yang diduga oleh Batman sendiri.

Rangkaian kematian misterius para mahasiswa di Universitas Gotham menarik Harley Quinn keluar dari persembunyian. Saat investigasinya bersimpangan dengan Batman, kedua musuh bebuyutan ini membentuk aliansi demi menghentikan ancaman sebenarnya, Scarecrow!

Setelah menembak mantan polisi, Eddie "The Riddler" Nygma bekerja sama dengan wanita misterius bernama Thorn. Cinta penuh kejahatan mereka memorak-porandakan Gotham hingga memaksa Batman beraksi.

Saat Batman melanjutkan mencari Rupert Thorne, investigasinya bersimpangan dengan Carrie Kelley, seorang detektif amatir yang mengaku sebagai "The Crime Smasher"! Mereka bekerja sama untuk melumpuhkan broker dunia bawah tanah Gotham, Mr. Zero!

Joker mengumumkan hukuman mati Wali Kota Jessop. Saat Gotham panik, GCPD berpencar untuk melindungi sang wali kota selama Batman memburu Joker. Apakah upaya mereka cukup untuk menghentikannya?

Hari Penghakiman tiba di Gotham saat sebuah wabah menyebar di seluruh kota, mengubah para warga menjadi maniak haus darah. Saat para penyintas bersembunyi ketakutan, para sekutu Batman bergerak untuk menyelamatkan mereka yang tersisa sementara Detektif Dark Knight menghadapi musuh besarnya, The Joker!