Musim ke 2

Seorang rekan tukang ledeng lamanya Max muncul kembali dengan niat jahat dan akhirnya mencuri Proyektor Null Void yang berbahaya.

Kutu alien raksasa pengisap planet mendarat di Bumi dengan tujuan utama untuk menghancurkan Bumi, dan hanya pahlawan alien baru yang dapat menghentikannya.

Kevin 11 kembali untuk membalas dendam. Dengan kemampuannya, ia berubah wujud menjadi pahlawan alien Ben, dan menjebak Ben atas kejahatannya.

Gwen mendapatkan Omnitrix dan seluruh kekuatannya. Kini, Ben harus mundur dan membiarkan Gwen 10 melawan Vilgax untuk menguasai perangkat tersebut.

Ben dan Kevin 11 dikirim ke sebuah pesawat luar angkasa dan di sana mereka harus belajar bertarung bersama untuk menjatuhkan promotor pertarungan alien yang kejam.

Ben bergabung dengan trio pahlawan alien antargalaksi yang melacak pemburu bayaran Six Six, tetapi kelompok pahlawan ini tidak seperti yang dibayangkan.

Saat sebuah ras jamur alien mengambil alih perkemahan musim panas, Ben menemukan alien baru untuk melawan ancaman itu.

Sebuah senjata alien ditemukan di Texas, dan keluarga Tennyson memulai petualangan saat mereka harus bertempur melawan Forever Knights demi memperebutkan senjata itu.

Kekuatan Lucky Girl-nya Gwen kembali saat ia membeli batu ajaib di sebuah konvensi sulap di Vegas. Namun, Hex berniat menghancurkannya untuk selamanya.

Ben, Gwen, dan Max diundang untuk melihat sebuah resor bawah laut baru, tetapi resor ini ditenagai oleh bola energi dan alien pemilik bola itu menginginkannya kembali.

Ghostfreak melarikan diri dari Omnitrix dan menjadi makhluk utuh yang merdeka. Ben harus mencari cara untuk membawanya kembali ke dalam Omnitrix, atau akan ada akibatnya.

Dr. Animo keluar dari penjara dan ingin membalas dendam. Dengan Omnitrix yang rusak, Ben harus berurusan dengan beberapa kombinasi alien yang aneh, seperti StinkArms.

Kabar baiknya adalah Ben telah membuka rahasia Omnitrix. Kabar buruknya, Kevin 11 dan Vilgax bekerja sama untuk mendapatkan rahasia itu.